outil de monitoring des modifications apportées dans PubMed, développé et maintenu par la ZB MED (Allemagne)

AMSTAR stands for A MeaSurement Tool to Assess systematic Reviews. There has been a proliferation of systematic reviews as one of the key tools for evidence-based health care. This has presented both opportunities and risks. [...] The risks include variation in quality and empirical validation.

Une liste de petites applications utilitaires qui ont la particularité de tourner intégralement dans le terminal, mais de proposer néanmoins une interface "graphique".

Une liste de petites applications utilitaires qui ont la particularité de tourner intégralement dans le terminal, mais de proposer néanmoins une interface "graphique".

Outil développé par Michael Gusenbauer permettant de comparer les bases de données pour cibler les bonnes ressources (ou simplement avoir une meilleure vision d'ensemble de ce que nous avons à disposition)

A free tool to give you the confidence to search the best databases available, so you find all you need, faster.

découvert grâce à Frédérique

Disk2vhd est un utilitaire qui crée des versions VHD (Virtual Hard Disk – Microsoft's Virtual Machine disk format) de disques physiques à utiliser dans Microsoft Virtual PC ou Microsoft Hyper-V virtual machines (VMs). La différence entre Disk2vhd et d'autres outils physiques à virtuels est que vous pouvez exécuter Disk2vhd sur un système en ligne. Disk2vhd utilise la capacité d'instantané de volume de Windows, introduite dans Windows XP, pour créer des instantanés cohérents à un instant donné des volumes que vous souhaitez inclure dans une conversion. Vous pouvez même demander à Disk2vhd de créer les VHD sur des volumes locaux, même ceux en cours de conversion (bien que les performances soient meilleures lorsque le VHD se trouve sur un disque différent de ceux en cours de conversion).

Sous le coude pour le dérouillage chimique (surtout avec électrolyse que j'ai jamais essayé)

Pour interroger tout le graphe (non divisé), il est possible d'utiliser QLever avec une syntaxe légèrement différente. Il s'agit d'une institution tierce qui fait une copie du graphe de manière régulière (tous les mois environ).
Exemple : Helen De Cruz (cf. ci-dessous)

PREFIX wikibase: <http://wikiba.se/ontology#>
PREFIX wd: <http://www.wikidata.org/entity/>
PREFIX wdt: <http://www.wikidata.org/prop/direct/>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>

SELECT DISTINCT ?work ?label WHERE {
  { ?work (wdt:P50 | wdt:P98) wd:Q47189712 .
 } UNION { ?work wdt:P2093 "Helen De Cruz" .
 }
  OPTIONAL { ?work rdfs:label ?label FILTER(LANG(?label) = "en") }
}

outil de visualisation permettant de voir les intersections de plusieurs ensembles, pour dépasser les possibilités offertes par le diagramme de Venn

décrit dans LEX, Alexander, GEHLENBORG, Nils, STROBELT, Hendrik, VUILLEMOT, Romain et PFISTER, Hanspeter, 2014. UpSet: Visualization of Intersecting Sets. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics [en ligne]. décembre 2014. Vol. 20, n° 12, pp. 1983‑1992. [Consulté le 25 août 2025]. DOI 10.1109/TVCG.2014.2346248. Disponible à l’adresse : https://ieeexplore.ieee.org/document/6876017

outil de dédoublonnage de références provenant de diverses bases de données

Removing duplicate references obtained from different databases is an essential step when conducting and updating systematic literature reviews. ASySD (pronounced "assist") is a tool to automatically identify and remove duplicate records.

À tester !

découvert grâce à Myriam (UNIGE)

Outil de recherche d'articles citant ou étant cité par une publication

Utile pour la phase de citation chasing d'une revue systématique moyennant de passer par l'API pour réaliser plusieurs requêtes, car l'interface de recherche semble limitée à la recherche d'une seule publication à la fois

Les données (publiées sous licence CC0) peuvent également être téléchargées pour travailler en local : https://download.opencitations.net/

"OpenCitations is managed by the Research Centre for Open Scholarly Metadata, an independent research centre within the University of Bologna." -- https://opencitations.net

Outil de recherche d'articles citant ou étant cité par un set de publications

Utile pour la phase de citation chasing d'une revue systématique

Citation.js (GitHub, NPM) converts formats like BibTeX, BibJSON, DOI, and Wikidata to CSL-JSON to convert to styles like APA, Vancouver and to BibTeX and RIS.

Pour en savoir plus, lisez l'article publié par PeerJ :

WILLIGHAGEN, Lars G., 2019. Citation.js: a format-independent, modular bibliography tool for the browser and command line. PeerJ Computer Science [en ligne]. 12 août 2019. Vol. 5, pp. e214. [Consulté le 3 août 2025]. DOI 10.7717/peerj-cs.214. Disponible à l’adresse : https://peerj.com/articles/cs-214

Toutes sortes d'outils qui peuvent s'avérer utiles lorsqu'on travaille avec Wikidata

Clean messy data and turn it into a knowledge graph with Ontotext Refine.

Liste d'outils à explorer et tester

Powerful evidence synthesis tools for medical researchers. Accelerate, collaborate, automate and share.

Outil d'aide à plusieurs étapes d'une revue systématique, mais dont je n'ai pas encore pu tester l'utilité, l'efficacité et la transparence...